【解析】：
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2019版教材P263
所谓最终结清，是指合同约定的缺陷责任期终止后，承包人已按合同规定完成全部剩余工作且质量合格的，发包人与承包人结清全部剩余款项的活动。选项A错误。
承包人按合同约定接受了竣工结算支付证书后，应被认为已无权再提出在合同工程接收证书颁发前发生的索赔。承包人在提交的最终结清申请中，只限于提出工程接受证书颁发后发生的索赔。提出索赔的期限自接受最终支付证书时终止。选项B错误。
最终结清时，如果承包人被扣留的质量保证金不足以抵减发包人工程缺陷修复费用的，承包人应承担不足部分的补偿责任。选项C错误。
最终结清付款涉及政府投资资金的，按照国库集中支付等国家相关规定和专用合同条款的约定办理。选项D正确。
2017版教材P253
C为什么错
答：不足部分承包人承担了
B为什么错
答：承包人按合同约定接受了竣工结算支付证书后，应被认为已无权再提出在合同工程接收证书颁发后发生的索赔。B说的合同享有的权利义务终止，明显不对的。
索赔权利的终止，应在承包人接受了最终支付证书这个时间点，而不是发包人签发最终支付证书这个时间点。用俗话来说，就是我接受了才说明我的权利终止了，而不是你发出了就说明我权利没了。"